Образован заповедник 21 апреля 1998 г. Постановлением Правительства РК №355 на площади 12 520 га и включал часть дельты реки Тентек на оз.Сасыкколь и острова озера Алаколь (Средний, Улькен Аралтобе, Кишкене Аралтобе), затем площадь заповедника была увеличена до 20743 гектаров.
Решением Акима Алакольского района Алматинской области №1-13 от 19 января 1999 г. "О предоставлении земельного участка Алакольскому государственному природному заповеднику из земель госземзапаса" был предоставлен дополнительный земельный участок в западной части дельты Тентека на озерах Байбала и Карамойын площадью 17 422,9 га.
Постановлением Правительства РК № 1025 от 5 октября 2010 года его площадь расширена на 45505 га за счет включения земель Урджарского района ВКО.
Заповедник состоит из двух частей, из них первая расположена в дельте р.Тентек на южном побережье озера Сасыкколь, вторая - на островах озера Алаколь.
Общая площадь Алакольского Государственного Природного заповедника составляет - 65 672,01 га
Цель создания заповедника - учрежден в целях сохранения природных комплексов, животного и растительного мира дельты реки Тентек, а также уникальной популяции реликтовой чайки и других колониальных птиц на островах озера Алаколь
Наименование государственного органа, в ведении которого находится особо охраняемая природная территория
Комитет лесного хозяйства и животного мира Министерства экологии, геологии и природных ресурсов Республики Казахстан
Местонахождение особо охраняемой природной территории
Казахстан, Алматинская область, Алакольский район,
г. Ушарал, ул. Кабанбай Батыра, 32
Телефон: (72833) 22663
Описание границ особо охраняемой природной территории
Алакольский государственный природный заповедник расположен в 282 км восточнее областного центра г. Талдыкорган, в 582 км от г. Алматы и в 510 км – от г. Усть-Каменогорск.
Расположен в пределах Алакольского района Алматинской и Урджарского района Восточно-Казахстанской областей Казахстана. По критериям «Международного союза охраны природы» (МСОП) РГУ «Алакольский государственный природный заповедник» относится к категории 1А.
Алаколь-Сасыккольская система озёр занимает пустынную впадину между горными системами Джунгарского Алатау и Тарбагатая в юго-восточной части Казахстана. В центре впадины находится система крупных озёр: Алаколь, Сасыкколь, Кошкарколь, Жаланашколь.
Территория заповедника разбросана по всей котловине и поделена на 6 географических участков: Северное побережье оз. Сасыкколь и система Тысячных озер; Дельта реки Тентек; Острова Аралтобе на оз. Алаколь; Дельта рек Эмель и Шагантогай; Залив Малый Алаколь; Восточное побережье оз. Жаланашколь и урочище Кызылкайын в Джунгарских воротах.